Старорусское мужское имя Домнин из-за похожести на фамилию и притяжательное прилагательное не стало общеупотребительным. Ударение с последнего перешло на первый слог, и получилась фамилия. Некоторые исследователи склонны думать, что образование этой фамилии связано с женским именем Домна (от латинского ‘госпожа’). Близки по смыслу Домнину и Домнину (такая фамилия тоже есть) Домничев, Домнов, Домнушкин, Домников.